A la par de la actividad médica y terapéutica y los demás servicios en salud y cultura que el Complejo San Rafael ofrece, la actividad que se realiza en esta Institución va necesariamente acompañada de una actitud investigadora, ya que se trata de estudiar e investigar sobre nuevos recursos terapéuticos profundizando en la ciencia antroposófica y ampliando el conocimiento del ser humano y su relación con la Tierra y el Cosmos, para instrumentar y poner en práctica nuevos conocimientos que hacen al arte de curar en su más amplio sentido.

Para ello, su campo de investigación es el siguiente:
a) investigar el elemento curativo en el reino de las plantas:

• en herboristería, en plantas autóctonas
  
• los principios activos y sus diferentes comportamientos en casos específicos (ciprés, capsicum [ají mejicano], muérdago criollo)
  
• composición química de las mismas y comparación con el medicamento de la ciencia natural;
  
• como uno de los ejes fundamentales la investigación realizada en el curso de varios años sobre el ceibo, y que aún sigue su curso.

b) dilucidar y ofrecer nuevos recursos terapéuticos en el campo del arte,

• en especial sobre las terapias basadas en la ciencia espiritual antroposófica tales como euritmia, quirofonética, formación del habla, musicoterapia,
  
• como también la terapéutica del trabajo individual y en grupo sobre el elemento del color, la pintura al agua, etc.
  
• el efecto desestresante del trabajo con la cerámica y la plástica, entre otros.
  
  

c) buscar nuevas formas de vínculos en lo social,

• fomentando la asociación entre los profesionales como una nueva forma de relación interdisciplinaria que a la vez podrá ofrecer una nueva forma de atención al paciente;
  
• formas participativas de uso de los espacios culturales;
  
  

d) promover aspectos concomitantes que hacen a la salud como ser la destreza corporal, la correcta alimentación, los efectos del estrés,

• Taller de Euritmia, nuevo arte del movimiento originado por el Dr. Rudolf Steiner, gran promotor del arte como componente esencial de la vida y la salud del ser humano;
  
• Taller de Gimnasia Bothmer, desconocida en nuestros medios, desarrollada en 1919 a instancias de Rudolf Steiner;
  
• Cursos de Alimentación, Jornadas de Desintoxicación, etc.
  
• Investigar en la elaboración del pan la forma de fermentar con elementos naturales;
• Investigar las formas de conservación y fermentación láctica, etc.

e) buscar y hacer valer el efecto que sobre la salud tiene el ámbito de la cultura en general y el de la música en especial,

• editar libros con textos que orientan sobre la medicina de orientación antroposófica;
  
• reducir la polución auditiva y declarar el Auditorio “espacio acústico” por sus excelentes condiciones sonoras, entre otros.

La metodología de investigación reside en desarrollar los nuevos conocimientos con la mayor rigurosidad científica en el ámbito humano en todas sus ramas, aplicando una modalidad diferente en la relación médico-paciente, para lo cual se despliega la actividad en el marco de:
- los Departamentos de Nutrición, Materno-Infantil, Prevención y Salutogenesis y el de Terapias Artísticas y Sociales que incursiona en una nueva manera de tratamiento de la discapacidad;

- del trabajo de un Equipo Pedagógico-Terapéutico especializado en el tratamiento de los problemas de atención y el síndrome de hiperactividad en los niños;

- la creación de un Gabinete de Investigación sobre plantas y extractos de plantas.

Las personas que llevan a cabo aspectos de la investigación científica desarrollan su labor como parte integrante del ejercicio de su oficio (como ser la atención médica o terapéutica de un paciente) o bien en forma desinteresada como parte de un estudio de profundización en la ciencia espiritual (trabajo de Rama o diversos grupos de estudio) o de una actividad interdisciplinaria como el Ateneo, que se realiza regularmente.